Tema | Nombre | Descripción |
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Pour en savoir + | Un site à explorer |
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Le blog de Xavier Nogues | Niveau Licence - Université de Bordeaux |
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La page de Marie Beurton-Aimar | Niveau Master - Université de Bordeaux |
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Séance 1 : Statistique descriptive/exploratoire univariée | Apprendre des notions théoriques | Lors de cette séance, nous souhaitons vous donner du sens à l'apprentissage de la statistique en biologie, toutes options confondues. Pour devenir autonome en analyse statistique, il vous revient de décider de consacrer du temps et de l'énergie à l'apprentissage des notions de base que vous trouverez dans ce fichier. Il vous revient de de prendre connaissance de ce document et de préparer vos questions pour la séance n°1. Bon travail ! |
Apprendre par l'expérience | Langage de la statistique - Rudiments de R |
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Documents de travail | Notions de base et exercices corrigés |
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Séance 2 : tests statistiques paramétriques | Apprendre les notions théoriques | Tests paramétriques : comparaison de moyennes par le test de Student, analyse de variance à un facteur, corrélation de Pearson |
Apprendre par l'expérience | Test de Student ; Analyse de variance à un facteur ; Corrélation de Pearson |
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Références : corrélation et causalités | A lire, pour éviter de confondre les deux relations. |
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Corrélation et causalité en biologie | A lire, pour éviter de confondre une corrélation et une relation de causalité. |
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Séances 3 et 4 : Tests statistiques non paramétriques | Documents de travail | Test de Wilcoxon ; Test de Kruskal Wallis ; Corrélation de Spearman |
La puissance d'un test statistique | Pour comprendre la différence de puissance entre un test statistique paramétrique et non paramétrique. |
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Corrections séance 3 | Code R pour réaliser les exercices |
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Le calcul de rangs | les ex-aequo (ties) |
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pour en savoir + | Test du Khideux |
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Test du Khi2 | Pour en savoir + |
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Séance 5 : Application sur un grand jeu de données | Documents de travail | Exercice corrigé |
Le lien vers l'article | Plant Physiol. 2009 Mar;149(3):1505-28. doi: 10.1104/pp.108.133967. Epub 2009 Jan 14. |
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L'article | Plant Physiol. 2009 Mar;149(3):1505-28. doi: 10.1104/pp.108.133967. Epub 2009 Jan 14. |
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Logiciel R pour l'analyse statistique | Guide de survie de R | Les instructions de R à acquérir |
Liste des fonctions vues en STAT-AEB | Impossible de ne pas les connaître |
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R pour les débutants | Document de E. PARADIS |
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Le site officiel du logiciel R | Pour installer gratuitement chez vous le logiciel R |
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Pour programmer avec R | Site en anglais |
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Graphiques avec R | Pour être un as des graphiques avec R. Site en anglais. |
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Un cours sur R | Un cours sur R en anglais |
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Une nouveauté de R | Pour les allergiques aux lignes de commande |