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URL Le blog de Xavier Nogues

Niveau Licence - Université de Bordeaux

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Niveau Master - Université de Bordeaux

Séance 1 : Statistique descriptive/exploratoire univariée Fil Apprendre des notions théoriques

Lors de cette séance, nous souhaitons vous donner du sens à l'apprentissage de la statistique en biologie, toutes options confondues.

Pour devenir autonome en analyse statistique, il vous revient de décider de consacrer du temps et de l'énergie à l'apprentissage des notions de base que vous trouverez dans ce fichier.

Il vous revient de de prendre connaissance de ce document et de préparer vos questions pour la séance n°1.

Bon travail !

Mappe Apprendre par l'expérience

Langage de la statistique - Rudiments de R

Mappe Documents de travail

Notions de base et exercices corrigés

Séance 2 : tests statistiques paramétriques Fil Apprendre les notions théoriques

Tests paramétriques : comparaison de moyennes par le test de Student, analyse de variance à un facteur, corrélation de Pearson

Mappe Apprendre par l'expérience

Test de Student ; Analyse de variance à un facteur ; Corrélation de Pearson

Mappe Références : corrélation et causalités

A lire, pour éviter de confondre les deux relations.

URL Corrélation et causalité en biologie

A lire, pour éviter de confondre une corrélation et une relation de causalité.

Séances 3 et 4 : Tests statistiques non paramétriques Mappe Documents de travail

Test de Wilcoxon ; Test de Kruskal Wallis ; Corrélation de Spearman

URL La puissance d'un test statistique

Pour comprendre la différence de puissance entre un test statistique paramétrique et non paramétrique.

Fil Corrections séance 3

Code R pour réaliser les exercices

URL Le calcul de rangs

les ex-aequo (ties)

URL pour en savoir +

Test du Khideux

URL Test du Khi2

Pour en savoir +

Séance 5 : Application sur un grand jeu de données Mappe Documents de travail

Exercice corrigé

URL Le lien vers l'article

Plant Physiol. 2009 Mar;149(3):1505-28. doi: 10.1104/pp.108.133967. Epub 2009 Jan 14.

Fil L'article

Plant Physiol. 2009 Mar;149(3):1505-28. doi: 10.1104/pp.108.133967. Epub 2009 Jan 14.

Logiciel R pour l'analyse statistique Fil Guide de survie de R

Les instructions de R à acquérir

Fil Liste des fonctions vues en STAT-AEB

Impossible de ne pas les connaître

URL R pour les débutants

Document de E. PARADIS

URL Le site officiel du logiciel R

Pour installer gratuitement chez vous le logiciel R

URL Pour programmer avec R

Site en anglais

URL Graphiques avec R

Pour être un as des graphiques avec R. Site en anglais.

URL Un cours sur R

Un cours sur R en anglais

URL Une nouveauté de R

Pour les allergiques aux lignes de commande